Protea cuenta con una excelente sala de manipulación de 2.000 m2 de superficie donde se recepciona la mercancía procedente de barcos y contenedores.
Desde el punto de vista logístico, esta sala funciona como centro de recepción, manipulación y distribución de la mercancía a las cámaras frigoríficas para su almacenaje o a la zona de expedición que conduce a los muelles de carga. En ella, se dispone de medios técnicos como centros de pesaje, cintas de clasificación, sistema de enfardado automático, carretillas elevadoras, etc. y personal cualificado que permiten manipular diariamente más de 500 toneladas.
La sala de clasificación cuenta también con una sala de escandallos perfectamente equipada para realizar todos los controles necesarios sobre la mercancía, tales como temperatura, peso, dimensiones, etc.